1. Какие плюсы и минусы у белой ликвидации и альтернативной

После белой проблем меньше. Неизвестных долгов не возникает. Альтернатива для жадных экономных.

2. компания сейчас на мертвом человеке- то есть наследник должен сперва на себя ее переоформить, как я понимаю, что в такой ситуации делать, дабы у наследника не было каких-либо проблем с органами? фирма ему не нужна, но просто так ее оставить я так понимаю тоже нельзя, тем более в случае каких-то проблем — через директора или в отсутствии его все равно выйдут на родственников единственного учредителя?

Наследник должен или принять наследство или отказаться от него. Частичный отказ законом не предусмотрен. Если фирма не нужна, он должен распорядиться имуществом в соответствии с законом, т.к. имущество это не только права, но и обязанности.